一般的には弥生会計などが定番商品のようです。
僕はfreeeというものを使い始めてみました。Googleのソフトウェアコンテストで1位になったらソフトです。特徴は口座やクレジットカードなどの情報をwebで接続し自動で引っ張ってきてくれるところです。また、仕分けもほぼ自動でやってくれるというのがウリになっています。
弥生会計もマネールックと連携し同様の機能を提供すると書いていますが、自動仕分けの精度はfreeeよりも若干劣るようです。また古いバージョンはマネールックとの連動機能を提供していないので定期的に新しいバージョンを買わなければいけないということになると思われます。また、 税理士さんが業界標準の弥生会計ソフト形式のファイルで提出を求めて来ることもあるものと思われますが、freeeでは弥生会計形式でのファイルのエクスポートもできるようです。
またfreeeの優れている点はアマゾンの取引明細の取り込みもできる点です。アマゾンの便利さをいまさら説明するまでもないと思いますが、朝に頼むと夜に届いたりもします。実際買いに行くよりも早いんじゃないかと思われるほどです。
口座の情報、カードの情報それに加えアマゾンの取引履歴にも取り込めるようになると、ほぼ手で入力しなければいけないものはほとんどなくなるぐらいです。
会計処理をするというのは生産性の無い仕事ですので、できるだけ手間をかけたくないですよね。freeeはほとんど自動化してくれるので、まだ使い始めたばかりですがだいぶいい感じなのではないかなぁと思っています。